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RNA杂交预杂交液/杂交液(100 mL,含50%甲酰胺)
RNA杂交预杂交液/杂交液(100 mL,含50%甲酰胺)
基本属性
| 属性 | 内容 |
|---|---|
| 产品名称 | RNA杂交预杂交液/杂交液(含甲酰胺) |
| 规格 | 100 mL |
| 主要用途 | Northern Blot预杂交与杂交孵育(RNA检测) |
| 保存条件 | -20 ℃避光保存(甲酰胺对光敏感) |
| 关键要求 | 所有试剂及耗材均须RNase-free |
配方组成(100 mL体系)
| 组分 | 用量 | 工作浓度 | CAS号(如适用) |
|---|---|---|---|
| 20×SSC(或SSPE) | 30 mL | 6× | — |
| 50×Denhardt's | 10 mL | 5× | — |
| 10% SDS | 5 mL | 0.5%(W/V) | 25155-30-0 |
| 甲酰胺(Formamide) | 50 mL | 50%(V/V) | 75-12-7 |
| 10 mg/mL Salmon DNA | 1 mL | 100 μg/mL | 438545-06-3 |
| dH₂O(DEPC处理) | 4 mL | — | — |
配制步骤
(关键步骤) 将10 mg/mL Salmon DNA储备液于沸水浴中加热10分钟变性,迅速冰浴冷却后备用。
在RNase-free操作条件下,按上表依次量取以下组分至200 mL RNase-free烧杯中:
30 mL 20×SSC(或SSPE)
10 mL 50×Denhardt's
5 mL 10% SDS
50 mL 甲酰胺(Formamide)
1 mL 变性Salmon DNA
4 mL DEPC处理dH₂O
充分混匀后,使用0.45 μm滤器过滤除杂。
-20 ℃避光分装保存。
与DNA杂交液的关键区别
| 比较项 | DNA杂交液 | RNA杂交液(本配方) |
|---|---|---|
| 甲酰胺 | ❌ 无 | ✅ 50% |
| RNase控制 | 无特殊要求 | ✅ 严格RNase-free |
| 典型杂交温度 | 65~68 ℃ | 42 ℃(含甲酰胺) |
| 主要应用 | Southern Blot | Northern Blot |
关键注意事项
RNase-free是绝对要求:所有试剂、枪头、离心管、移液器、操作台面必须为RNase-free。DEPC处理水配制所有组分,操作时佩戴手套,避免皮肤和唾液中的RNase污染样品。
甲酰胺光敏感性:甲酰胺对光敏感,且反复冻融会降解产生甲酸,影响杂交严谨性。建议分装后-20 ℃避光保存,避免反复冻融。
甲酰胺毒性:甲酰胺为致畸物,操作时必须在通风橱内进行,佩戴手套和护目镜。避免吸入蒸气。
鲑鱼精DNA前处理:使用前必须煮沸变性10分钟并迅速冰浴冷却,使其成为单链短片段,方可有效封闭膜上的非特异性位点。未变性的Salmon DNA不具备封闭功能。
过滤除杂:使用0.45 μm滤器过滤,去除SDS低温析出结晶及Denhardt's溶液中的不溶物。不可高压灭菌。
SDS低温析出:若配制后出现沉淀,37℃水浴加热溶解即可,不影响使用。
预杂交与杂交操作流程
| 步骤 | 溶液 | 温度 | 时间 |
|---|---|---|---|
| 预杂交 | 本溶液(不含探针) | 42 ℃ | 2~4小时 |
| 杂交 | 本溶液(含变性RNA探针) | 42 ℃ | 12~16小时(过夜) |
💡 甲酰胺可降低DNA/RNA杂交的Tm值,使杂交在较低温度(42 ℃)下进行,有效保护RNA靶标不被降解