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大肠杆菌基因型表示方法速查表
大肠杆菌基因型表示方法速查表
| 序号 | 表示方法 | 示例 | 说明 |
|---|---|---|---|
| 1 | 根据基因产物或作用产物英文名称首字母缩写为三个斜体字母 | dam | DNA Adenine Methylase → dam |
| 2 | 变异基因不同但结果相同时,用作用结果英文名前三个字母斜体+大写字母区别 | recA, recB, recC | Recombination → recA、recB、recC |
| 3 | 基因或领域缺失时,在前面加“△” | Δ(lac-proAB) | lac-proAB基因缺失 |
| 4 | 质粒或噬菌体片段变异/缺失,用“0”或“/”区别 | /F'[traD36, proAB, lacIᵠ, lacZΔM15] | 区别于野生型,F'附加体携带 |
| 5 | 用表现型代替基因型(如抗药性) | Strᴿ, Ampˢ | 第一个字母大写,“+”或“R”表示抗性,“-”或“S”表示敏感 |
| 6 | 根据特异性蛋白变异及其导致结果表示 | rpsL | 核糖体30S亚基S12蛋白变异(链霉素抗性) |
基因型表示方法图解
text
基因命名规则 变异标记规则 ───────────────────────────────────────────────── 产物英文名 → 三字母缩写 野生型 → 无标记 例: dam (DNA Methylase) 突变型 → 小写(如 recA) 缺失型 → Δ(如 Δlac) 表现型规则 抗性标记规则 ───────────────────────────────────────────────── 基因型(小写) → 表型 抗性 → ᴿ 或 ⁺(如 Ampᴿ) 例: recA → RecA⁻ 敏感 → ˢ 或 ⁻(如 Ampˢ) (重组酶缺陷)
常用基因型表示符号解读
| 表示符号 | 含义 | 示例解读 |
|---|---|---|
| 小写字母 | 功能缺失突变(敲除) | recA = RecA功能缺陷 |
| 大写字母+数字 | 多基因家族区别 | recA, recB, recC = 不同重组相关基因 |
| △(Delta) | 区域/基因缺失 | Δ(lac-proAB) = lac-proAB区域完全缺失 |
| ::(双冒号) | 插入突变(转座子插入) | mutS215::Tn10 = Tn10插入mutS基因 |
| F‘ | F附加体携带 | F'[proAB+, lacIq, lacZΔM15] |
| +(上标) | 功能正常/野生型 | proAB+ = proAB功能正常 |
| –(上标) | 功能缺失/缺陷 | hsdR– = hsdR功能缺陷 |
| R(上标) | 抗性(Resistance) | tetR = 四环素抗性 |
| S(上标) | 敏感(Sensitive) | strS = 链霉素敏感 |
| /(斜线) | 区分不同遗传元件 | F'/染色体 或 质粒/染色体 |
基因型书写规范要点
| 规范 | 说明 | 正误对照 |
|---|---|---|
| 斜体书写 | 基因型名称通常用斜体表示 | ✅ recA ❌ recA |
| 大小写含义 | 小写=突变/缺陷;大写=功能正常 | ✅ recA(突变) vs RecA(蛋白) |
| 基因座/等位基因 | 基因座数字表示不同等位基因 | recA1 = recA基因1号等位突变 |
| 抗性标记大写 | 抗性标记第一个字母大写 | ✅ StrR ❌ strR |
典型菌株基因型解读示例
| 菌株 | 基因型片段 | 解读 |
|---|---|---|
| DH5α | recA1 | RecA重组酶功能缺陷,外源DNA稳定 |
| DH5α | endA1 | 核酸内切酶I缺陷,质粒纯度高 |
| DH5α | hsdR17 | 限制酶EcoK缺陷,外源DNA易转化 |
| DH5α | lacZΔM15 | β-半乳糖苷酶α片段缺失,蓝白斑筛选标记 |
| XL1-Blue | Tn10(tetR) | Tn10转座子携带四环素抗性基因 |
| BL21(DE3) | hsdS(rB– mB–) | B株限制-修饰系统缺陷,外源DNA可接纳 |
| JM110 | dam dcm | Dam和Dcm甲基化酶缺陷,质粒非甲基化 |
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