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色素在聚丙烯酰胺凝胶中的迁移参照表
色素在聚丙烯酰胺凝胶中的迁移参照表
一、非变性聚丙烯酰胺凝胶
| 胶浓度 | 溴酚蓝对应DNA片段(bp) | 二甲苯青FF对应DNA片段(bp) |
|---|---|---|
| 3.5% | 100 | 460 |
| 5.0% | 65 | 260 |
| 8.0% | 45 | 160 |
| 12.0% | 20 | 70 |
| 20.0% | 12 | 45 |
💡 使用提示:二甲苯青FF迁移位置可粗略指示大片段DNA电泳进程;溴酚蓝迁移位置指示小片段DNA/引物位置。
二、变性聚丙烯酰胺凝胶
| 胶浓度 | 溴酚蓝对应DNA片段(bp) | 二甲苯青FF对应DNA片段(bp) |
|---|---|---|
| 5.0% | 35 | 130 |
| 6.0% | 26 | 106 |
| 8.0% | 19 | 70~80 |
| 10.0% | 12 | 55 |
| 20.0% | 8 | 28 |
💡 使用提示:变性胶中色素迁移速率快于非变性胶(同等浓度下),因DNA变性后结构松散,迁移速率改变。
应用要点
| 序号 | 要点 | 说明 |
|---|---|---|
| ① | 电泳终止判断 | 溴酚蓝跑至凝胶底部时停止电泳,防止小片段DNA/引物跑出凝胶 |
| ② | 片段大致位置 | 二甲苯青FF位置可估算大片段DNA位置(如300 bp片段通常位于溴酚蓝和二甲苯青之间) |
| ③ | 胶浓度选择 | 高浓度胶(12%–20%)适合小片段,低浓度胶(3.5%–8%)适合大片段 |
| ④ | 变性 vs 非变性 | 变性胶中色素迁移速率不同,不能混用参照数据 |