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RNase A(核糖核酸酶A)是一种在分子生物学实验中广泛应用的RNA水解酶。其核心功能是在不破坏DNA的前提下,特异性地降解RNA,是去除核酸样品中RNA污染的关键工具酶。
产品核心特性
| 特性 | 描述 |
|---|---|
| 来源 | 主要从牛胰腺中提取,也有通过重组技术生产的产品。 |
| 分子量 | 约为13.7 kDa的单链多肽。 |
| 作用机制 | 作为一种内切核糖核酸酶,特异性切割单链RNA上胞嘧啶(C)或尿嘧啶(U) 残基的3'端磷酸二酯键。 |
| 酶活定义 | 通常以Kunitz单位计量,例如一些产品的活性可达≥80 Kunitz U/mg。 |
| 稳定性 | 性质高度稳定,在多种反应条件下均能保持活性。 |
技术原理
RNase A的作用机制具有高度特异性,这也是其成为理想工具酶的基础。
对RNA的特异性切割:RNase A作为一种核糖核酸内切酶,能够识别并水解单链RNA分子中特定核苷酸之间的磷酸二酯键。其切割位点具有高度选择性,主要作用于嘧啶核苷酸(胞嘧啶C和尿嘧啶U)的3'端。
对DNA的惰性:RNase A对DNA分子没有降解活性。这是因为DNA的核糖在2'位置缺少一个羟基(-OH),而这正是RNase A在催化水解过程中形成关键中间产物(2',3'-环磷酸)所必需的。因此,RNase A可以安全地用于DNA制备,它只会降解RNA杂质而不会影响目标DNA的完整性和浓度。
产品形式与关键参数
RNase A通常以粉末或即用型溶液的形式提供,用户可根据实验需求选择。
核心应用场景
RNase A是分子生物学实验中的常规工具,其主要应用包括:
RNA酶保护分析:在RNA酶保护实验中,RNase A用于降解未与探针杂交的单链RNA,而保护的RNA:RNA双链则不会被切割。
核酸杂交与突变分析:可用于切割RNA-DNA或RNA-RNA杂交体中的未配对区域,例如在检测单碱基突变(如RNA酶错配切割法)的应用中。
使用建议与注意事项
为确保最佳使用效果,操作时需注意以下几点:
避免污染:RNase A性质稳定,不易失活。操作时应使用无核酸酶的耗材,并佩戴手套,以防引入外源RNase污染。
反应条件:RNase A在多种反应条件下均有活性,其最适pH约为7.0-8.0,最适温度约为37℃,但在15-70℃范围内均能发挥功能。盐浓度会影响其活性:在低盐(0-100 mM NaCl)条件下,可切割单链RNA、双链RNA及RNA-DNA杂交链中的RNA;在高盐(≥0.3 M NaCl)条件下,则仅特异性切割单链RNA。
DNase污染:某些RNase A产品可能含有微量的DNase活性。在需要绝对避免DNA降解的实验(如基因组DNA制备)中,应选用经DNase-free认证的RNase A产品。对于常规产品,也可通过煮沸处理来灭活可能存在的DNase。
灭活方法
RNase A性质稳定,常规加热(如65℃, 10分钟)不足以使其完全失活。为确保彻底灭活,可采用以下方法:
DEPC处理:使用焦碳酸二乙酯(DEPC)处理溶液,可有效灭活RNase A。DEPC通过修饰酶的组氨酸残基来使其失活。
蛋白酶K消化:在蛋白提取实验中,使用蛋白酶K(Proteinase K)不仅可以降解蛋白质,也能消化RNase A等酶类。
品质保障
选择高纯度的RNase A对于实验结果的可靠性至关重要。优质产品通常经过严格质检,确保:
综上所述,RNase A是一种特异性强、稳定性高、应用广泛的工具酶,是分子生物学实验室中去除RNA污染、纯化核酸与蛋白样品的常规选择。
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