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核酸清除剂:从配制原理到使用要点全解析
01 核酸清除剂的作用机制
核酸清除剂是一种专门降解DNA和RNA分子的喷雾型试剂,能够在数分钟内将核酸片段彻底断链清除,从根本上杜绝PCR假阳性[1]。
其作用机理是在表面活性剂与氧化剂等组分的协同作用下,先将吸附于器材表面的核酸解离下来,再通过化学方式将核酸链断裂降解。具体而言:
表面活性剂降低表面张力,使核酸从固相表面脱附进入溶液
氧化剂产生活性氧自由基,攻击核酸的碱基与磷酸二酯键,使DNA/RNA失活断链,失去作为模板被扩增的能力
02 核心配方组成
市售核酸清除剂的配方虽各有差异,但核心功能模块基本一致。下表汇总了常见配方的成分分类及作用[2]:
| 成分类别 | 常用原料 | 核心功能 | 参考用量 |
|---|---|---|---|
| 氧化剂 | 次氯酸钠、过氧化氢(选其一)、过氧化脲 | 产生活性氧自由基,破坏核酸碱基结构与磷酸骨架 | 0.1%~10% |
| 表面活性剂 | SDS、Tween-80、十二烷基二甲基氧化胺 | 降低表面张力,使吸附的核酸从器材表面脱附 | 1%~8% |
| 金属螯合剂 | EDTA、柠檬酸 | 螯合金属离子,抑制残留核酸酶活性 | 1~15 mmol/L |
| pH调节剂 | 氢氧化钠、有机酸 | 创造适宜降解的pH环境,辅助核酸变性 | 0.5%~1.0% |
| 溶剂 | 去离子水、乙醇 | 作为载体,保证各组分均匀分散 | 余量 |
氧化剂选择的权衡:
| 氧化剂 | 优势 | 劣势 | 适用场景 |
|---|---|---|---|
| 次氯酸钠 | 氧化力强,降解效率高 | 对金属有腐蚀性 | 台面、离心管架、生物安全柜内壁 |
| 过氧化氢 | 对金属较温和,分解产物为水 | 降解效率略低于次氯酸钠 | PCR仪热盖、金属部件、精密仪器 |
| 过氧化脲 | 固体形态,稳定性好 | 溶解度有限 | 配制固体配方或需要稳定缓释的场景 |
03 标准配制流程(以次氯酸钠体系为例)[3]
以下配制步骤以次氯酸钠体系为例。如使用过氧化氢,见步骤四中的特别说明。
步骤一:配制碱性母液
将氢氧化钠(终浓度0.5%~1.0%)溶于适量去离子水中,搅拌至完全溶解。溶解过程为放热反应,容器外壁会明显发热,需待溶液自然冷却至室温后再进行下一步。
步骤二:加入表面活性剂
缓慢加入SDS(终浓度1%~2%)或Tween-80(终浓度1%~5%),持续搅拌至完全溶解。
SDS溶解要点:SDS在室温下溶解较慢(尤其浓度>2%时),建议在不超过40°C的水浴中加热助溶,待完全溶解后再冷却至室温。Tween-80溶解较快,直接搅拌即可。
步骤三:加入螯合剂
加入EDTA溶液(终浓度1~15 mmol/L),搅拌均匀。
步骤四:加入氧化剂(关键步骤)
待溶液完全冷却至室温(<30°C) 后,缓慢加入次氯酸钠(终浓度0.1%~1%),室温搅拌至均匀。
⚠️ 氧化剂必须最后加入——若提前混合,氧化剂会与表面活性剂、螯合剂等组分发生反应而失效。
⚠️ 使用过氧化氢时的特别注意:过氧化氢在强碱性条件(pH > 11)下分解显著加速。步骤一中0.5%~1.0%氢氧化钠已将体系pH调至约13。如果以过氧化氢代替次氯酸钠,建议将氢氧化钠浓度降至0.1%~0.2%(使pH约10~11) ,或加入后即用,不宜久存。不进行pH回调直接加入过氧化氢,有效成分会在数小时内分解殆尽。过氧化氢推荐用量为1%~3%。
步骤五:定容与分装
加去离子水定容至目标体积,混匀后转入喷壶备用。
04 保存条件
配制后应避光保存于不透明容器中(次氯酸钠见光分解加速)
次氯酸钠类配方建议开封后30天内使用完毕
过氧化氢类配方建议开封后7天内使用完毕(若已按上述建议降低了pH,分解速率会放缓,但建议尽量现配现用)
若溶液出现颜色明显变浅(次氯酸钠)或大量气泡产生(过氧化氢),说明有效成分已分解,应重新配制
配伍禁忌:
次氯酸钠不得与酸混合(会产生有毒氯气)
避免与还原性物质、金属粉末、铵盐等接触
05 使用要点
操作流程:
将清除剂喷洒于待处理表面,确保完全润湿
静置5~10分钟,为降解反应留足时间
用洁净纸巾或无尘布擦拭干净
对金属等敏感材质,可用纯水二次擦拭去除残留
精密仪器处理方式:
PCR仪热盖、荧光定量仪检测孔、移液器内杆等精密部件,不建议直接喷洒
建议将清除剂喷洒在洁净无尘纸上,再用湿润的纸擦拭表面,避免液体渗入仪器内部
擦拭后静置5分钟,再用干纸擦去残留
处理频率建议:
每周固定进行常规清洁
大批量样品处理前后即时清洁
出现假阳性结果后立即全面清洁
06 清除效果验证方法
配制或购买清除剂后,建议通过以下方式验证清除效果:
验证流程:
取洁净实验台面或离心管架,划分两块区域(A区和B区)
A区喷洒清除剂,静置10分钟后擦拭;B区喷洒去离子水(空白对照),同法操作
用无菌棉签蘸取去离子水,分别擦拭A区和B区表面
将棉签头剪入PCR管,以棉签洗脱液为模板进行PCR扩增(引物选用实验室常用基因)
比较A区与B区的Ct值或条带亮度
判定标准:
A区Ct值比B区延迟≥5,或A区条带明显弱于B区 → 清除效果合格
A区与B区Ct值无明显差异 → 清除效果不达标,需检查清除剂浓度、作用时间或更换配方
建议首次使用新产品或新配方时进行此验证,并记录结果作为实验室质控存档。
07 即用型商业化产品

如您希望省去原料筛选、配方优化、配制验证等环节,同时确保清除效果的稳定性与可靠性,杭州富沃克生物科技有限公司提供即用型核酸污染清除剂成品——采用专用核酸降解配方,不含强酸强碱与腐蚀性残留成分,可快速降解双链DNA、单链DNA、RNA、质粒片段及扩增产物等各类核酸污染物,3~10分钟即可完成清除。产品适配PCR仪、生物安全柜、移液器、离心管架等各类实验器材。
| 产品名称 | 规格 | 产品货号 |
|---|---|---|
| 核酸清除剂 | 100 mL / 300 mL / 600 mL | HSQ606-01 |
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参考文献
[1] 青岛立见诊断技术发展中心. 一种核酸祛除剂: CN110684605B[P]. 2021-08-10.
[2] 思凝一云. 核酸清除剂 Nucleic Acid Cleaner[EB/OL]. 科创中国, 2023-11-09.
[3] 王占奎, 杨云华, 王敏, 等. 一种核酸、核酸酶污染清除剂及其制备方法和应用: CN118421404A[P]. 2024-08-02.
